Synopsis
Après avoir vaincu leur ancien ennemi juré, les Tortues ont pris des chemins différents. Leonardo est parti s'entraîner en Amérique centrale et les autres vivent une vie sans but. Michelangelo et Donatello ont monté une petite entreprise, mais leur discipline se dégrade. Des événements étranges commencent à se produire à New York et les Tortues doivent les combattre. Elles doivent s'unir à nouveau et retrouver leur discipline de ninja pour combattre les créatures anciennes qui menacent de conquérir le monde. Leur maître zen doit les rassembler et les aider à surmonter leurs défauts et leurs insécurités pour arrêter le mal qui a infiltré la ville.