Victor Frankenstein est un enfant intelligent, mais pas très apprécié. Les enfants de l'école le traitent comme un paria. Son meilleur ami est son chien, Frankenweenie. Lorsque son animal bien-aimé est blessé et meurt, Victor refuse d'accepter sa perte et entreprend de ramener son meilleur ami à la vie. Une fois la résurrection accomplie, Victor doit convaincre ses parents, ses camarades de classe et la communauté que son gentil chien n'est pas vivant, mais qu'il est toujours le même.